Esta imagen provocó una crisis en su carrera, resultando en un periodo de estancamiento y depresión.[1] Durante este período, se encontró con obras de Carl Gustav Jung y comenzó a analizar sus sueños.[1] Sus nuevas obras no fueron bien recibidas por la comunidad artística suiza, y pasaron varios años antes de que se lograra el reconocimiento suficiente como para proporcionar a Birkhäuser y a su esposa un ingreso satisfactorio.UU.[1] En 1971, su esposa murió a los 32 años, y el desarrolló una seria dolencia pulmonar.[1] En 1980, una selección de sus últimos trabajos fue publicada en el libro Light from the Darkness: The Paintings of Peter Birkhäuser, editado y presentado por su hija e hijo, Eva Wertanschlag y Kaspar Birkhäuser, con comentarios sobre las pinturas de Marie-Louise von Franz.