Tras unos 128 kilómetros, desemboca en el río Váh en Kolárovo, a una altitud de 106,5 m sobre el nivel del mar.

[1]​ El río atraviesa las localidades de Kolárovo, Vrakuňa, Most pri Bratislave, Malinovo, Zálesie, Tomášov, Jelka, Jahodná y Trstice.

En el Pequeño Danubio y sus alrededores viven varias especies de animales protegidos.

Entre los mamíferos destacan la nutria europea y la rata almizclera, mientras que entre las aves se puede mencionar el cisne, la garza real, la focha común, la cigüeña blanca, el avetorillo común, el martín pescador y el ánade real.

La flora acuática está representada principalmente por el pino acuático, el nenúfar blanco, el nenúfar amarillo, la broza del Canadá, la filigrana menor, la espadaña, la lechuga de agua y la lenteja de agua común.