Desde muy joven sirvió a bordo de las galeras, con quince años ya se halló combatiendo en Italia (1600), y un año después en la campaña de Argel conducida por el príncipe Juan Andrea Doria.

Este fue sustituido entre 1612-1617 por Octavio de Aragón debido a su tardanza en regresar al puesto, lo que le ocasionó choques contra Pedro Téllez-Girón y Velasco, el famoso Duque de Osuna.

Dispuso la venta y composición de tierras, y mediante su ejecución obtuvo dos millones de pesos para la Monarquía Hispánica.

Aunque tendió a «la conservación, buen tratamiento y alivio de los indios», reconoció que estos tenían por enemigos a corregidores, curas y caciques, «atentos a enriquecer de su sudor», y que ninguna preocupación mostraban por obedecer las providencias dictadas para amparar a aquellos.

Del segundo matrimonio nacieron Antonio Sebastián de Toledo Molina y Salazar, segundo marqués de Mancera y Antonia María Álvarez de Toledo Molina y Salazar.