Pedro Farfán de los Godos (Sevilla, Corona de Castilla, Monarquía Hispánica c. mediados del siglo XVI - San Salvador, Reino de Guatemala c. 1623) fue un español que ejerció el cargo de alcalde mayor de San Salvador desde 1614 a 1620.
[1] Pedro Farfán de los Godos nació en Sevilla alrededor de mediados del siglo XVI; posteriormente, en su adultez contraería matrimonio con Jerónima de Medrano, con quien engendraría a sus hijos Pedro y Catalina Farfán.
[1][2] El 26 de octubre de 1613 sería designado, por el rey Felipe III, como alcalde mayor de San Salvador; por lo que se embarcó hacia el continente americano en compañía de su esposa, hijos, seis criados, una africana y una mulata.
[1][4] En el año de 1619 fue acusado de ofensas contra la iglesia y los indígenas;[5] por lo que al no poder pagar la fianza de 2.000 tostones al receptor general de penas de cámara y gastos de justicia Martín de Solorzano, fue apresado y llevado a la prisión de la Real Audiencia de Guatemala, donde solicitaría (a través de su abogado Nicolás de Penagos) que se le enviará a guardar prisión a su casa debido a estar muy enfermo, pero dicha solicitud sería rechazada y continuaría guardando prisión en la cárcel.
[5] En 1621 la real audiencia guatemalteca lo exoneraría de sus cargos y lo liberaría de prisión, por lo que se trasladaría a vivir a San Salvador;[1] muy probablemente fallecería por 1623, ya que en ese año el rey Felipe IV envió una real cédula al presidente-gobernador de Guatemala para que le pagase 1000 ducados a Jerónima de Medrano (viuda de Farfán de los Godos) para que con sus hijos realizara el viaje a España.