Le Jeune nació en 1591 en una familia hugonote, protestantes franceses,[1]​: 30  en Vitry-le-François en la región de Champaña, Francia.

[3]​ Le Jeune recibió una minuciosa preparación para servir bajo el sacerdocio jesuita; fue novicio durante dos años entre 1613 y 1615, y estuvo profundamente influenciado por su mentor, el padre Massé, a quien conoció en el colegio Henri IV de La Flèche.

Conocido por su trabajo con la población de Primeras Naciones, Le Jeune mostró un entusiasmo por aprender varios idiomas nativos americanos.

[4]​ Durante el viaje tuvo que lidiar con las burlas y la hostilidad ocasional del chamán Carigonan.

[7]​ Le Jeune decidió que para llevar a cabo eficazmente su apostolado, necesitaba establecer asentamientos misioneros, siguiendo el modelo de la obra misional jesuita en San Ignacio Miní en Misiones Argentina y la región fronteriza de Paraguay, un hospital para atender a los ancianos y enfermos.

Si bien había menos esclavos en las colonias francesas que en las inglesas y españolas, las interacciones de Le Jeune con los esclavos africanos en Quebec sentaron un precedente clave que inspiraría a generaciones posteriores de sacerdotes, maestros, activistas y abolicionistas.

La práctica jesuita consideraba que todas las personas eran iguales ante Dios y tenían la misma necesidad de salvación.

Ya en 1634, Le Jeune expresó entusiasmo porque se encontraba enseñando el alfabeto a niños africanos, y en el Volumen V de The Jesuit Relations enfatizó la necesidad de que los africanos obtuvieran suficiente aprendizaje y alfabetización para que pudieran demostrar una comprensión suficiente del idioma católico.

Dado que los jesuitas enfatizaron constantemente el papel del intelecto, defendieron la educación de los esclavos en todas las colonias.

Los jesuitas sostenían que enseñar el catecismo, pasajes bíblicos e historias religiosas era la función principal de la alfabetización en Nueva Francia .

Como parte del documento, los amos de esclavos debían ofrecer acceso al bautismo católico.

Cuando los franceses se establecieron en Luisiana, en territorio estadounidense, había una clara sensación de que la alfabetización y la religión estaban interconectadas.