En el año 2002 aproximadamente, la parroquia sufrió un pequeño hundimiento que alertó a las autoridades de Zamora Chinchipe para su futura reubicación.
A esta “nueva ciudad”, la bautizaron como “San Joseph de Loyola”.
En este juicio, se mencionan algunos pueblos, sitios, ríos, montañas, curas, españoles, caciques e indígenas de Yaguarzongo, entre los años 1650 y 1726; de gran interés histórico-geográfico.
Al poseer armas de fuego, para los vecinos españoles, mestizos e indígenas, era fácil el avistar (léase ir de cacería y/o pesca), con lo que desde 1558, fecha en que se fundó la primitiva Loyola, habían transcurrido hasta 1698, 140 años de exterminar, pájaros, palomas, monos, dantas, venados, armadillos, yamalas, majazes, murrucujes, perdices, guataracos, etc. b) Las tierras de cultivo, eran cada vez más pobres y sus estancias y chacras, estaban cada vez más lejos Esto se demuestra fácilmente, porque las tierras de nuestra Amazonía, solo producen bien durante unos 2 o 3 años seguidos, luego no sirven para cultivos de ciclo corto.
Por este motivo, tenían que hacer sus chacras, huertas, y estancias (las actuales fincas), cada vez más lejos, con la inseguridad de que en cualquier momento, sean atacados por los “jíbaros rebeldes”.
Además el caminar por lodazales, y en medio de la maleza, sometidos al acecho de las fieras, víboras, zancudos y otros insectos, para cosechar lo poco que sembraban, les hacía muy difícil su tarea.
c) No había suficientes indios para las minas y otros trabajos.
Al haber sobreexplotado por 140 años, sus fincas o estancias, los pastizales eran muy pobres y escasos, que no servían para mantener sus ganados.
e) Se quedaron prácticamente aislados de otras ciudades como Loja, Jaén.
f) Por buscar nuevos mercados en pueblos del norte peruano como: Huancabamba, Jaén, Chirinos, y Piura, para sus productos agrícolas, ganaderos y el oro que producían.
Estas nuevas y mejores tierras eran los valles de Chito, Zumba, El Vergel, Pucapamba (incluía Zapanga, La Chonta, Zapanga, El Chorro y El Tablón), El Pite, El Api o El Ape – como ellos así los llaman- que encontraron, en su incesante búsqueda de mejorar su situación.
h) Por las continuas epidemias de viruela, sarampión, paludismo, etc.; que causaron grandes estragos en la población india.
i) Por las frecuentes rebeliones de los indígenas; los españoles forzosamente emigraron a lugares más seguros, como Loja, Vilcabamba, Yangana, Quinara, Malacatus, Amaluza, Cariamanga y algunas ciudades y pueblos del norte peruano.
El origen de su nombre se debe al hallazgo hecho por los primeros pobladores de abundantes cultivos agrícolas como zapotes, naranjas y limones que hasta la actualidad se producen en la actual parroquia.
Esta zona se encuentra amenazada por actividades humanas de colonización y explotación aurífera.