El Marquesado de San Nicolás es un título nobiliario creado por Carlos III en 1761.
En consecuencia, los marqueses trasladaban las correspondencias municipales al palacio, de manera que este se convirtió, con el tiempo, en ayuntamiento de la villa, función que mantiene hasta hoy.
Actualmente, el palacio pertenece a la Comunidad Autónoma de La Rioja.
En 1996, se finalizó una reforma importante en el palacio encargada por el Ministerio de Cultura.
El palacio acoge, asimismo, una amplia variedad de otras exposiciones temporales.