Debido a la represión nazi, fue detenido en varias ocasiones y en diversos momentos estuvo internado en campos de concentración.

Hacia el final de la Segunda Guerra Mundial, en 1945 logró evitar ser reclutado por las autoridades nazis para cumplir servicio en el Volkssturm.

En 1946 se produjo la unificación entre ambos movimientos en el nuevo Partido Socialista Unificado de Alemania (SED), que con los años se convertiría en el partido gobernante de la Alemania oriental.

[3]​ Por este motivo, desde 1961 no estuvo muy activo en su puesto al estar recibiendo tratamientos médicos en la Unión Soviética.

[6]​ Grotewohl estuvo casado con Marie Martha Luise desde 1919 a 1949; la pareja tuvo dos hijos.