En 1985 fundó el Instituto de Estudios Políticos y Relaciones Internacionales (Iepri) en la Universidad Nacional.
En los últimos años impulsó la conformación del Centro Estratégico de Pensamiento Alternativo y dirigió la revista CEPA.
Su obra es consultada desde diversas disciplinas, al considerarse que activa innovaciones metodológicas en la práctica sociológica.
[11] Varias Instituciones educativas llevan su nombre en Bogotá, como el Colectivo Sociojurídico Orlando Fals Borda que se dedica al acompañamiento a familiares de víctimas de desaparición forzada y ejecuciones extrajudiciales a raíz del conflicto interno colombiano.
En Montería (Córdoba) se encuentra el Centro de Documentación Regional Orlando Fals Borda del Banco de la República a partir del archivo donado por Fals Borda en 1979.