Los misiles balísticos fueron embarcados a Cuba disimulados en buques mercantes pero pronto fueron detectados por fuentes de inteligencia estadounidenses, tanto mientras se encontraban en ruta hacia la isla como ya en Cuba.

Las tropas fueron transportadas en 86 buques, que realizaron unos 180 desde los puertos de Baltiysk, Liepāja, Sebastopol (Sevastópol), Feodosia, Mykoláiv (en ruso transliterado, Nikoláyev), Poti y Múrmansk.

No obstante, la creciente presión diplomática estadounidense, reforzada por el bloqueo naval dispuesto por el mandatario John F. Kennedy (denominado cuarentena -quarantine- para no provocar excesivamente a la URSS), terminaron haciendo que el entonces líder soviético Nikita Jrushchov terminase deponiendo su actitud.

UU., por su parte, se comprometieron a retirar los misiles nucleares PGM-19 Júpiter que habían instalado o emplazado en Turquía).

Los comandantes de las otras tres naves sumergibles fueron severamente amonestados por haber ascendido y sido expuestos.