La rama militar estaría dirigida por el Oberkommando der Luftwaffe (Cuartel General Supremo de las Fuerzas Aéreas).

Sin embargo, la separación de las ramas militares y civiles no estaba completa.

Estas eran: El objetivo de esta formación era principalmente debilitar a Milch, quien había obtenido atención favorable del partido.

Incluía las siguientes ramas:[1]​[3]​ Otras áreas tales como el entrenamiento, la administración, la defensa civil y el diseño técnico permanecieron bajo control del RLM.

La nueva organización demostró ser más eficiente y permaneció hasta el final de la guerra.

[1]​ El OKL, al igual que el OKH o el OKM comparecía ante el Alto Mando Supremo de las Fuerzas Armadas (Oberkommando der Wehrmacht, OKW).

Era responsable de proveer estructuras administrativas y logísticas, así como recursos para cada aeródromo.