La localidad adquirió el carácter de comuna en el siglo XV.

Alrededor del 1500 se construyeron en Oberägeri varias capillas y el primer edificio de gobierno.

En 1669 la comuna ganó el derecho de elegir su propio sacerdote.

En 1766 los gobiernos de Oberägeri y Unterägeri (entonces conocida como Wilägeri) iniciaron una lucha abierta durante las sesiones parlamentarias, lo que llevó a la división en dos comunas en 1798.

Ese mismo año se construyó la primera escuela de la comuna .