[3][4] A ellos se sumó el presidente saliente de la FECh, Felipe Melo Rivara, que había sido elegido a fines de 2004 representando a una lista integrada por la Fuerza Social, el movimiento SurDa y la Juventud Socialista.
[5] El año de su fundación, la Nueva Izquierda logró que Nicolás Grau resultara electo presidente de la FECh, apoyado por el movimiento SurDa.
En 2008 la Nueva Izquierda Universitaria se alió a las Juventudes Comunistas, en la lista "Estudiantes de Izquierda" (EEII), que logró la presidencia de la Federación durante tres años consecutivos, de los cuales uno perteneció al NIU, Federico Huneeus,[7] y dos a las Juventudes Comunistas, Julio Sarmiento y Camila Vallejo.
La misma alianza entre las Juventudes Comunistas y la NIU se sostiene en la universidad privada Alberto Hurtado, logrando la Federación de estudiantes el año 2009 con Jonathan Serracino, y posteriormente el año 2011 la Nueva Izquierda UAH gana la Federación liderada por Miguel Echeverría,[8] sin el apoyo de las JJCC.
La alianza "Estudiantes de Izquierda" se rompió en 2011, debido a las diferencias que las Juventudes Comunistas y la Nueva Izquierda tuvieron respecto al rol de la Federación —dirigida por Camila Vallejo— durante la movilización estudiantil de ese año.