La tienda incluye diversas secciones llamadas Wii U, Nintendo 3DS y Pokémon Negro y Blanco 2, que sustituye The Pokémon Center que originalmente se encontraba en el edificio, y ha sido movido a una subsección de la tienda.

En la segunda planta de la tienda, hay quioscos con varios videojuegos para Wii en funcionamiento, permitiendo jugar a cualquier persona.

Nintendo New York organiza regularmente torneos con premio para los ganadores, demostraciones, y lanzamientos de nuevos juegos.

Una vez obtenido el ticket Eon, se podía pasar a otros jugadores con una copia del juego de forma gratuita a través de StreetPass.

En su reapertura, la tienda pasó a llamarse "Nintendo New York".