[a]​[5]​ En esta cercanía familiar a la corte se fundamentaría el que Nicolás formara tempranamente parte del hostal del rey, figurando desde 1429 como boticario de la reina Blanca I de Navarra.

[6]​ Gracias al Papa Eugenio IV fue desde 1439 el sucesor del Cardenal Basilio Besarión que, procedente de la Iglesia Griega, fuera luego Obispo Administrador de Pamplona.

Propuesto para Papa a la muerte del Papa Nicolás V, en 1455, gobernó la sede pamplonesa su vicario general Juan de Michaelis.

El Papa entonces excomulgó a las autoridades de Estella, Falces (los Carrillo - Peralta llegarían a ser Marqueses de Falces en el tiempo del Imperio), Sangüesa (en la frontera navarro-aragonesa y a pocos kilómetros de la aragonesa Sos donde nació el «rey Católico»), Peralta, etc.

Sería el Papa Paulo II quien mandaría a su legado pontificio Rodrigo Borja a que en la Catedral de Valencia, durante tres domingos, Pedro de Peralta «el Joven» hiciera pública exhibición de su arrepentimiento y, aunque descalzo y con ropas simples, no llevara al cuello una cadena de hierro como sus secuaces, posiblemente por la estirpe de su familia.

[cita requerida] Es una aproximación genealógica bastante importante, pero no necesariamente coincidente con la nuestra que nos ha sido, sin embargo, muy útil para precisar puntos importantes.