[2]​ Desde 1989, Nafin otorga recursos financieros y garantías, principalmente como Banco Nacional, además de ser agente financiero del Gobierno Federal en lo relativo a la negociación, contratación y manejo de créditos del interior, cuyo objetivo sea fomentar el desarrollo económico; así como ofreciendo servicios fiduciarios a los sectores privados.

Para promover canales alternos de financiamiento, en 1942, Nacional Financiera inició su participación accionaria en las empresas.

En su último informe al Congreso, en septiembre de 1946, el presidente Manuel Ávila Camacho resumió con las siguientes palabras la acción cumplida durante su sexenio por la Nacional Financiera:

En esta etapa, la transformación institucional se basa en cuatro vertientes fundamentales: Durante 2003, Nafin certificó, bajo la Norma de Calidad ISO 9001:2000, sus 18 procesos, adelantándose a la meta de certificación programada para el año 2006.

En los mercados financieros, la institución continuó siendo uno de los operadores más importantes del país.