Alberga 1500 piezas, la mayor parte data del siglo XX.

Entre la colección alberga imaginería cusqueña, mates huantinos y retablos ayacuchanos.

[2]​[3]​ Fue diseñado en estilo neoinca por el arquitecto Ricardo de Jaxa Malachowski.

[4]​ El antecedente del museo, el Instituto de arte peruano fue creado en 1931 por el decreto ley no 7084[5]​ como un instituto anexo al departamento de antropología del Museo Nacional, para propiciar el estudio del arte prehispánico y de las artes populares.

Fueron también miembros y colaboradores del instituto los artistas Julia Codesido, Alicia Bustamante, Enrique Camino Brent, Teresa Carvallo, Apu-Rimak y el fotógrafo Abraham Guillén.