[1]​ Fue una iglesia veneciana habitada por frailes franciscanos; es un monumento importante de La Canea.

[1]​ Durante la ocupación otomana fue convertido en mezquita, a la que Yussuf Pasha, el conquistador de la ciudad, le puso su nombre.

[1]​ En el siglo XX fue sede del cine “Idaion Andron” y después de la Segunda Guerra Mundial sirvió como almacén para equipamiento militar, hasta que albergó el museo en 1962.

[1]​[2]​ Posteriormente, se ha construido un nuevo edificio para el museo en el campamento Chatzidakis, en la zona histórica de La Canea que da al mar.

Del periodo minoico neopalacial son destacables los objetos procedentes de Nerokuros.

Hay un pixis de arcilla que representa a un citaredo.