En el centro se encuentra ubicada la punta norte del Valle de Tehuacán, el cual solo presenta pequeñas elevaciones y en el que se ubican las localidades más pobladas del municipio.

El municipio de Tepanco posee tres tipos de climas, derivados de las condiciones hidrológicas, geológicas y morfológicas del territorio; Semiseco semicálido, ubicado en el centro y sureste del municipio abarcando aproximadamente el 30.57%, Semiseco templado, que se distribuye por centro, norte y noreste y representa el 33.71%, y Templado subhúmedo con lluvias en verano, de menor húmedad distribuido en las secciones noroeste y suroeste del municipio, incluye el 35.72% del territorio.

En cuanto a la distribución de los usos del suelo, está mayormente cubierto por matorrales, representando un 43.54%, el 41.50% está destinado a la agricultura y la zona urbana representa solo un 8.69% del territorio, el pastizal y mezquital ocupan un 2.83% y 2.30% respectivamente, el restante 1.14% se considera como no aplicable a definición.

Fauna: Conejo, tlacuache, rata, ardilla, zorrillo, cacomixtle, coyote, venado, tuza, murciélago, águila real, gavilán, zopilote, golondrina, lechuza, paloma, zanate, garza, cardenal, gorrión, cuitlacoche, carpintero pechigris, falsa coral, serpiente de cascabel y serpiente ratonera, entre otros.

[6]​ En la punta sur y la porción noreste del municipio, se encuentran partes pertenecientes a la Reserva de la biosfera Tehuacán-Cuicatlán, cercanas a las poblaciones de San Bartolo Teontepec y San Luis Temalacayuca, respectivamente, esta última en los cerros referentes a la Sierra de Tecamachalco.