Esta región estuvo habitada por los tarascos y fue conquistada en 1530 por Nuño de Guzmán.

A fines del siglo XVII la mitra de Valladolid concedió sacerdote de pie y pila bautismal al poblado, según petición del cura Sebastián Nieto.

Aunque desde 1825 perteneció al 3.º Cantón de La Barca muy visitado por todos en sus fiestas patronales hermoso pueblo donde se descansa muy bien la gente muy amigable El municipio de Jesús María se localiza en la región altos Sur del estado de Jalisco.

La roca predominante es la extrusiva ácida (34.2 %) se trata de rocas ígneas de origen volcánico vertido a la superficie a través de fisuras o volcanes y El suelo predominante es el luvisol (34.7 %), se caracteriza por la acumulación de arcilla, son suelos rojos o amarillentos, destinados principalmente a la agricultura con rendimientos moderados y alta susceptibilidad a la erosión.

Los tipos de recursos hídricos del municipio están constituidos por aguas subterráneas, ríos y lagos.

Sus recursos hidrológicos son proporcionados por el río huáscato; los arroyos: Las canoas, San Agustín, Palo Caído y Ayo; lagunas y presas: Ojo Zarco, Saltillo, Regladero, La Luz y parte de La Pólvora, que irriga principalmente terrenos de Ayotlán.

La mayor parte del municipio de Jesús María (76.8 %) tiene clima templado subhúmedo.

Jesús María alberga cuenta con 0.5 % de humedales sin algún área natural protegida tipificada en su territorio.

En esta región la fauna es escasa, aunque existen liebres, paloma habanera,venado y mapaches.

Comparando este volumen poblacional con el del año 2015 (19,469 habitantes), se observa que la población municipal disminuyó un 2.5 por ciento en cinco años.

Jesús María obtiene un desarrollo institucional Alto con un IDM-I de 68.6.