[5]​[6]​ Machar también nombró al general Simon Gatwech Dual como Jefe del Estado Mayor General del Ejército, designado por DCoGS para operaciones, capacitación, orientación política y moral, logística, administración y finanzas.

La gente de las zonas controladas por los rebeldes ya no aceptaba la moneda sursudanesa, que había perdido su valor debido a la hiperinflación, y en su lugar utilizaba dólares estadounidenses y birres etíopes.

[11]​ La ideología del partido (o en algunos casos, la falta de ella) es esencialmente idéntica a la del SPLM original, y sólo difiere en el hecho de que la división entre los dos se produjo principalmente por líneas étnicas, con el SPLM-IO representando al mismo pueblo Nuer grupo étnico como líder Riek Machar.

En 2018, el analista sursudanés Duop Chak Wuol cuestionó la estrategia general del SPLM-IO, argumentando que el liderazgo del movimiento buscó una solución política como parte de sus esfuerzos para poner fin a la guerra civil sin un buen plan para su ala militar.

Aquellos elementos del ejército de Sudán del Sur que se unieron al SPLA-IO lo hicieron para proteger intereses étnicos, además de sentirse poco representados por el nuevo gobierno.