Pero el hechicero logra escapar al Mundo Exterior mientras Goro distrae la atención de los guerreros presentes desde la Tierra.
Fuera de la academia, Raiden ordena a Liu Kang y Kung Lao que viajen al Mundo Exterior.
Mientras exploran los pasillos del monasterio, los monjes ven a Kitana varias veces, burlándose de los guerreros.
Liu Kang y Kung Lao logran hacer esto, matando a Jade en el proceso.
Después de esto, Kitana también desaparece y los monjes siguen a Reptile al Bosque Viviente.
En el Bosque Viviente, Liu Kang y Kung Lao se separan para encontrar a Reptile.
Al final de su viaje por este lugar, ven a Shang Tsung recuperando su juventud.
En los páramos del Mundo Exterior, los monjes se encuentran con Sub-Zero, quien intenta matarlos, considerando a ambos como sus enemigos.
Sub-Zero lo sigue para vengar el asesinato de su hermano mayor, mientras que Liu Kang y Kung Lao se encuentran con Goro.
Liu Kang dice que debería haber matado él a Goro e intenta iniciar una pelea con Kung Lao.
Scorpion encuentra a los guerreros, pero los monjes logran ganar en una difícil batalla de tres fases contra el espectro.
A pesar de usar sus transformaciones, Shang Tsung pierde ante los monjes y Liu Kang lo asesina rompiéndole el cuello.
Habiendo derrotado al shokan de cuatro brazos, los monjes entran en batalla con el mismísimo Emperador del Mundo Exterior, Shao Kahn.
Durante la invasión Tarkatana a la Wu Shi Academy Raiden es derrotando por Shang Tsung y este toma su forma para engañar a Liu Kang y Kung Lao para que entren en un nuevo Mortal Kombat, el verdadero Raiden volvería aparecer ya al final del juego para intentar derrotar a Shao Kahn donde con su poder petrifica al emperador para que así Liu Kang y Kung Lao pudieran dar el golpe final y terminar el torneo de una vez por todas.
Johnny Cage: Es un actor y artista marcial que estuvo presente durante el primer torneo.
Ella durante la invasión tarkatana a la Wu-Shi Academy es secuestrada y llevada al Mundo Exterior por Baraka.
Jade: Es una Guerrera Edeniana, ella junto a Kitana y Mileena son las primeras jefas del juego.
Liu Kang y Kung Lao después que lo vieran en The Portal lo siguen hasta Living Forest para enfrentarlo.
Este se encuentra oculto en Living Forest no es un jefe ni un personaje jugable, simplemente nos dará cinco misiones a través de los reinos, tras completar todas sus misiones, se desbloqueará el antiguo Mortal Kombat II para jugar en el menú.
Los combos y los movimientos especiales aumentan a medida que se adquieren puntos de experiencia.
Están allí para ayudar a los personajes principales Raiden, Johnny Cage, Sonya Blade, Jax y Sub-Zero; mientras, otros sirven como los jefes del juego: Kitana, Mileena, Jade, Reptile, Baraka, Goro, Scorpion, Ermac, Kano, Shang Tsung, Kintaro y Shao Kahn.
Algunos de estos se pueden desbloquear para convertirse en personajes seleccionables en los distintos modos del juego.
En las tumbas del alma, los símbolos que brillan intensamente sobre las entradas a dos rutas alternativas significan “Fuego” y “Viento”.
Su idea era darle al jugador más libertad para realizar múltiples movimientos a la vez que en cualquier otro juego de aventuras.
El equipo añadió muchos elementos de Mortal Kombat al juego para hacerlo más atractivo.
1UP.com estaba en conflicto con la dificultad del juego, ya que la IA puede ser demasiado fuerte, pero podría obligar al jugador a usar movimientos más creativos.
[12] Por otro lado, GameZone sintió que las peleas con los jefes eran más agradables debido a las tácticas necesarias para derrotarlos.
[21] XPlay elogió la gran cantidad de combos y movimientos finales que el jugador puede realizar y recomendó a la audiencia que use el modo cooperativo para disfrutar aún más del juego.
[13] WorthPlaying comentó que la trama de Shaolin Monks se basa más en el factor nostalgia en contraste con su juego anterior, Deception, ya que los personajes favoritos de los fanáticos como Johnny Cage y Raiden a menudo aparecen en el juego para ayudar a los personajes principales.
[25] Paradox planeó desarrollar una secuela centrada en Scorpion y Sub-Zero, titulada Mortal Kombat: Fire & Ice, pero las restricciones financieras provocaron la cancelación del proyecto.