La historia del inmueble pasaría desapercibida hasta que en tiempos de la guerra civil española se reunieran bajo su amparo gentes de toda la ciudad para hacer trueques de alimentos e incluso reuniones prohibidas, por lo que los trabajadores del molino decidieron inventar la leyenda de que un duende habitaba en la construcción.

La más significativa es la de un niño que supuestamente murió en el arroyo accidentalmente y su espíritu merodea por las inmediaciones.

Sean reales o no, el Molino del Cubo es un lugar imponente de Torredonjimeno, ya que esta construcción ha sobrevivido a cinco siglos.

La forma con la que diseñaron la construcción era cúbica, de ahí su nombre.

Aprovechaba la cascada de agua que caía del arroyo para hacer girar la noria que se encontraba en la parte superior del molino.