El modelado PBPK se usa en investigación y desarrollo farmacéutico, así como en evaluación de riesgo en la salud.Dada esa propiedad, modelos PBPK puede tener usos puramente predictivos, excepto otros usos, como la inferencia estadística, que se ha hecho posible por el auge de herramientas estadísticas Bayesianas capaces para ocuparse de modelos complejos.Los modelos PBPK hacen un intento para confiar a priori en la estructura anatómica y fisiológica del cuerpo.Otros son "no-paramétricos" en el sentido que se necesitó un cambio en el modelo en sí (p.ej., cuando se extrapola hacia una mujer embarazada, las ecuaciones del feto deben ser consideradas).
