El Ministerio de Guerra ayudaría a someter al Ejército a revisión constitucional, y junto con el Estado Mayor General sistematizaría la conducción de la guerra.Scharnhorst también operó como Ministro de Guerra en funciones, ya que no se realizó ningún nombramiento permanente.La primera división representaba la continuación del antiguo Ayudante General y también era conocido como el "gabinete militar secreto".Este a su vez tenía control sobre la cancillería de guerra.La segunda división del Ministerio de Guerra trataba con asuntos del ejército generales: formación de tropas, reemplazos y rotaciones, alojamiento, ejercicios militares, y movilización.
