Durante la Revolución, la Asamblea Nacional Constituyente creó una dirección a cargo de las colonias en 1791.

El vínculo con la Marina Nacional francesa, creado en 1626, se mantuvo y los asuntos coloniales se mantuvieron bajo el Ministerio de Marina hasta la Tercera República.

[7]​ Martinica, Guadalupe, Guayana Francesa y Reunión, que fueron convertidas en departamentos de ultramar en 1946, pasaron a depender del Ministerio del Interior.

[5]​ Los siguientes funcionarios dependen del ministro: oficina del gabinete; correo parlamentario; servicio de prensa e información; misión de trabajo legislativo; embajador delegado para la cooperación regional en la zona de Antillas y Guayana; embajador delegado para la Cooperación Regional en la Zona del Océano Índico; Secretario Permanente para el Pacífico; y asesor militar de defensa.

[11]​ La organización administrativa del ministerio ha dependido durante mucho tiempo de la estructura establecida en 1979.