Pertenece al municipio homónimo y a la región administrativa de Dinamarca Meridional.

Posiblemente desde el siglo XII Middelfart era ya un sitio importante en el tránsito entre Jutlandia y Fionia, además de tener una destacada actividad pesquera especializada sobre todo en la captura de la marsopa (que persistiría hasta finales del siglo XIX).

A partir del siglo XVI comenzó un período de declive para Middelfart.

En el siglo XVIII la ciudad empezó a recuperarse con el establecimiento de un nuevo puerto y la explosión agrícola, que impulsaron el comercio.

En la segunda mitad del siglo la ciudad siguió creciendo aunque a un ritmo bastante menor.