La microbiota seminal son las bacterias no patógenas presentes en el semen humano sano.
En el semen se encuentran bacterias del género Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus y Ralstonia.
[3] Se ha argumentado que las parejas heterosexuales comparten las microbiomas de sus sistemas reproductores.
[4] Al igual que otros hábitats de microbiomas humanos como la microbiota intestinal, la vaginal o en la leche materna, el líquido seminal humano también alberga un microbioma que incluye varios cientos de especies bacterianas por individuo con varios niveles de abundancia.
Si consideramos un grupo o población de hombres, sus microbiomas de semen son independientes en tiempo ecológico en general, y cada individuo no es diferente a una isla disponible para que los microorgamismos invadan y/o habiten.