Es endémica del sudeste de Bahia en Brasil donde se encuentra en áreas rocosas.Micranthocereus dolichospermaticus se encuentra al oeste del Río São Francisco, en el suroeste de la Bahía y el noroeste de Minas Gerais, Brasil, que se extiende desde Santana (Bahia) en el norte de Manga (Minas Gerais), en el sur.Los ovales areolas están cubiertas de lana marrón brillante.Micranthocereus dolichospermaticus fue descrita por (Buining & Brederoo) F.Ritter y publicado en Kakteen in Südamerika 1: 108.[2] Micranthocereus: nombre genérico que deriva de las palabras griegas: "μικρός" micra = "pequeño", ἅνθος antha = "flor" y Cereus = un género de las cactáceas.