El sistema fue inaugurado el 28 de diciembre de 2004, haciendo de Shenzhen la sexta ciudad en China continental en tener un metro después de Pekín, Tianjin, Shanghái, Cantón (Guangzhou) y Wuhan.
El Metro de Shénzhen en la actualidad cuenta con 16 líneas, 369 estaciones y 555.39 kilómetros de red, lo que le convierte en el quinto sistema de metro con mayor kilometraje de la China Continental y el mundo.
El sistema actual tiene 16 líneas y proporciona una manera relativamente rápida y económica de viajar en la parte centro-oriental de Shénzhen, en comparación con los autobuses y taxis.
El periodo de prueba llegó justo a tiempo para las celebraciones del Año Nuevo Chino con frecuencia de 15 minutos.
Se centrará en las líneas 6 y 8 y se extenderá la longitud del metro de Shenzhen a 348 kilómetros y 10 líneas.