Está ubicado en el extremo sur del Departamento de Ocotepeque, a gran altitud.
En 1868, varios comuneros compran la Hacienda Santa Teresa del Cimarrón y del Río Chiquito a la heredera Jerónima Castejón M. vecina de Sensenti.
[3] El nombre de la localidad fue puesto en honor a su santa patrona, la Virgen de las Mercedes.
Posiblemente su nombre tenga conexión con los dueños originales Castejón Milla, dado que una de sus descendientes, Mercedes Reyes (Milla) estaba entre los comuneros que compraron la Hacienda que origina el Municipio.
[4] La base económica del municipio es la producción de café, ganadería, granos básicos y algunas microempresas.