Nació en Santo Domingo de la Calzada, ciudad castellana y actualmente en La Rioja, donde tomó el hábito.

Fue la responsabilidad que más problemas generó con el cabildo catedralicio durante los veinte años de su magisterio.

La disputa fue creciendo hasta que en mayo de 1515 se exigió a Rivaflecha su renuncia.

[1]​[4]​ En julio de 1518 se concedió al maestro un permiso para visitar a su madre, posiblemente enferma.

Solo se ausentó dos años y medio, ya que en diciembre de 1525 regresaba a su magisterio palentino como racionero.