Durante el periodo de la dictadura militar, Ortega tuvo que posponer su tesis para irse a Iquique, donde encontró trabajo como antropóloga en el Museo Arqueológico R.P.
Debido a la necesidad, termina en esta fecha su tesis de título bajo la tutela del profesor Alberto Medina.
Obtiene en 1981 la beca para desarrollar sus estudios de posgrado en la London School of Economics donde obtuvo una maestría en Antropología Social.
[7] Originalmente su interés en investigación académica estuvo centrado en «migración chilota a la Patagonia desde una perspectiva local»; sin embargo, esto cambió hacia el estudio de los pueblos andinos del Norte de Chile.
[1] Marietta Ortega ha desempeñado un papel significativo en la preservación y estudio de la cultura Chinchorro.