En 1635 el matrimonio se deterioró; su hermana la encontró llorando en la cama después de que su marido la hubiera golpeado.
En una ocasión su hija Cornelia fue encerrada por su padre y, en 1641, Maria Thins decidió mudarse a Delft, donde su hermano vivía.
En 1664 su hijo Guillermo, licenciado sin empleo, fue encerrado en una institución después de una discusión con su madre y tras atacar a su hermana embarazada con un palo.
No estuvo obligada a reducir su parte al mínimo legal, aunque mencionó que la había estado insultando desde su juventud.
En 1675 Vermeer se embarcó en varios viajes de negocios para su suegra, la primera en Gouda, cuando su marido ya había muerto, y luego a Ámsterdam.