Para Federico, esta fue una razón para finalizar su gobierno conjunto y dividir el país.

El hermano de Margarita, Wolfgang, fue el segundo príncipe del Imperio, después de Federico III, que se convirtió al luteranismo.

El poeta Philip Engelbrecht dedicó un epitalamio para Juan y Margarita en 1514.

Juan se dedicó a su esposa y la quería mucho.

Desde su matrimonio, Margarita y Juan tuvieron los hijos siguientes: