Actualmente es director deportivo del equipo belga Lotto Soudal.

En 1997 y 1998 Wauters no ganó ni una sola carrera, aunque llegó a ser 7.º en el Campeonato Mundial de Ciclismo de 1998, su posición más alta en este evento durante su carrera.

Wauters era conocido como un trabajador en el pelotón y no ganaba mucho, pero ayudaba a sus compañeros de equipo, donde logró resultados decentes.

Wauters se escapó del grupo junto con Arnaud Pretot, quien derrotó en el sprint final.

Debido a su buen resultado en el prólogo, dos días antes en Dunkerque se vistió de maillot amarillo durante un día, antes de perderlo dejándoselo a Stuart O'Grady.