En algunas fuentes se la conoce simplemente como María Farnesio.

Nacida en Parma como el sexto hijo y la segunda hija de Ranuccio I Farnesio y de Margarita Aldobrandini.

Su hermano mayor, Eduardo Farnesio, fue más tarde duque de Parma.

Ella fue propuesta como novia del rey Carlos II de Inglaterra,[1]​ pero los planes de matrimonio nunca se materializaron y Carlos a su vez se casó con Catalina Enriqueta de Braganza.

Isabel murió al dar a luz como su madre.