Manuel II Gran Comneno (en griego: Μανουήλ Β΄ Μέγας Κομνηνός, Manouēl II Megas Komnēnos; c. 1324-1333) fue emperador de Trebisonda durante ocho meses en 1332.
Aunque los turcomanos penetraron profundamente en territorio trebero, fueron rechazados con grandes pérdidas.
Los crímenes de su padre habían sorprendido a la gente a tal punto que se habían dividido en facciones rivales, centrándose en la capital y las ciudades.
El partido probizantino en la capital invitó al tío de Manuel Basilio a regresar a Trebisonda de Constantinopla y hacerse cargo del gobierno.
Sin embargo, una rebelión fracasada en su favor, dirigida por el megaduque Juan el Eunuco en febrero de 1333, llevó a su tío Basilio a ordenar su ejecución.