En 1468-1470, su marido Ivar Axelsson Tott se convirtió en el sucesor prometido del rey como regente.

Su marido era el tío de Ingeborg Tott, esposa del regente Sten Sture el Viejo.

Ivar había sido consejero real en Dinamarca; se había mudado a Suecia en 1464, y después de su matrimonio con Magdalena, fue nombrado consejero real de Suecia.

Ivar Axelsson traicionó a Suecia, admitiendo en 1476 que el rey danés le había prometido Gotland como feudo, y en 1481, un conflicto tomó lugar entre Ivar y el regente sueco.

Magdalena fue la benefactora de la abadía de los Frailes Grises en Riddarholmen, Estocolmo, a la cual le hizo muchas donaciones importantes, y fue honrada por los monjes con la inscripción Propentissima Benefactrix Ordinis Nostri.