Fue nombrado en homenaje al general Milan Rastislav Štefánik, cuya aeronave se estrelló en Bratislava en 1919.
Está ubicada a 9 km (5,59 millas) al noreste del centro de la ciudad, ocupando una superficie de 4,47 km² y es conocida por su extraordinariamente buenas condiciones climáticas.
Opera vuelos regulares e irregulares, tanto domésticos como internacionales.
El aeropuerto cuenta con dos pistas perpendiculares (04/22 y 13/31), los cuales fueron reconstruidos totalmente en la década de 1980.
La pista 13/31 cuenta con la categoría 2 de la OACI para la aproximación y aterrizaje.
El aeropuerto también es la base de Seagle Jet (afiliada a Seagle Air), VIP Air y el Servicio de Vuelo del Gobierno Eslovaco.