Jugó hasta los 25 años de edad en los equipos de la EMT de Madrid —en infantiles y juveniles—, Rayo Vallecano, Cartagena FC y Club Deportivo San Fernando entre otros, hasta que se retiró para formarse como entrenador.

Fue técnico de las categorías inferiores del Leganés hasta que comenzó a entrenar al primer equipo a partir de la temporada 1989-1990.

Después entrenó al Getafe C. F., S. D. Compostela, Real Ávila, U. D. Almería y Cultural Leonesa, tanto en Segunda División como en Segunda División B, donde consiguió dos ascensos de categoría más.

Desde 2006 hasta 2010 ejerció como director deportivo del Club Deportivo Leganés, y además compaginó este cargo con el de entrenador en las temporadas 2005- 2006 y 2009-2010.

Tras una serie de malos resultados, Duque presentó su dimisión y después dejó todos sus cargos en el club.