LTR, del inglés Long Terminal Repeat) es una secuencia de nucleótidos característica que se encuentra en cada extremo de un elemento retroviral que ha sido integrado en el genoma hospedador.
Las secuencias LTR se transcriben parcialmente en un ARN intermediario, para posteriormente y mediante transcripción reversa pasar al ADN complementario (ADNc) y finalmente al ADN bicatenario (dsADN de las siglas "double stranded") con LTRs completas.
Los extremos de las LTR participan subsecuentemente en la integración del provirus en el genoma hospedador.
Una vez se ha integrado, la LTR de 5' funciona como promotor del genoma retroviral completo, mientras que la LTR de 3' proporciona la poliadenilación del ARN naciente y, en VIH-1, VIH-2 y SIV, codifica para la proteína accesoria Nef.
En VIH-1 la región 5'UTR ha sido caracterizada de acuerdo a las diferencias funcionales y estructurales en diversas subregiones.