Paul McCartney se mostró disconforme, sobre todo con "The Long and Winding Road", por los arreglos orquestales de Phil Spector.

Más tarde, publicaría, ya en 2003, Let It Be... Naked, un disco doble con los temas sin los agregados de Spector.

McCartney dijo que escribió "Let It Be" tras soñar con su madre durante las tensas sesiones para la grabación del álbum Get Back.

[3]​[4]​ Posteriormente McCartney declaró: En una entrevista posterior declaró que su madre le había dicho: El máster fue grabado el 31 de enero de 1969, como parte del proyecto Get Back Album, con McCartney al piano (un Blüthner Flügel), Lennon al bajo de 6 cuerdas, Billy Preston al órgano Hammond y piano eléctrico, George Harrison a la guitarra eléctrica y Ringo Starr a la batería.

[8]​ La voz principal de McCartney fue acompañada por Lennon y Harrison, como se podía ver en el documental.

Algunos seguidores creen erróneamente que existían dos versiones de la pista básica, basadas en los diferentes solos, pero también en arreglos y mezclas.

[10]​ El título de la portada del sencillo (que usaba las mismas fotos de cubierta que el álbum) decía: "An intimate bioscopic experience with THE BEATLES" (Una íntima experiencia bioscópica con THE BEATLES).

[10]​[12]​ Estos añadidos se grabaron en la misma sesión en la que Harrison arregló el segundo solo de guitarra.

Otra versión de la canción estuvo recogida en el álbum Let It Be... Naked, del año 2003.

[8]​[24]​ En la entrevista que Playboy hizo a Lennon en 1980, este negó toda implicación en el proceso compositivo de la canción.

Johnny Indovina, exvocalista de Human Drama, y quien recientemente formó su nuevo proyecto The Sound of the Blue Heart, hizo su propia versión en la reedición de un disco que lanzó en solitario, llamado Moments in Time, en 2005.

[cita requerida] En el tributo a John Lennon "A Tribute to John Lennon, Live"; el cantante, pianista y saxofonista estadounidense de soul y R&B, Ray Charles versionó la canción "Let It Be".

The Streets usó «Let It Be» como base para una canción dedicada a la muerte del padre de Mike Skinner llamada «Never Went to Church».