La clasificación de esta familia es un problema abierto y su relación con otras lenguas Níger-Congo todavía divide a los expertos.

Durante el siglo XX se llevaron a cabo numerosos trabajos de campo en los montes Nuba.

[5]​ Todos estos trabajos ampliaron notablemente el conocimiento que se tenía a principios del siglo XX de estas lenguas.

Gradualmente a lo largo del siglo XX, la extensión de las lenguas kordofanas, sus características gramaticales, el léxico, y las relaciones entre ellas se fueron conociendo mejor.

Lo que no está tan claro son las relaciones internas de esos cuatro grupos.