[1]​ El lago está formado por el desborde del río Desaguadero en su desembocadura en el lago Poopó, sobre la extensa planicie sedimentaria denominada "Santo Tomás" (pues en ella se encontraba una pequeña ermita y unas cuantas casas que fueron inundadas por completo).

Por ello, aparentemente no será posible preservar sus recursos hidrobiológicos.

Sus necesidades respectivas son de 4 m³/s y 3,3 m³/s para mantener niveles de agua que permitan desarrollar la flora y la fauna acuáticas.

Sumado a esto está la gran variabilidad en la superficie ocupada por el lago, que crea unas zonas llamadas llanuras de inundación donde las condiciones para la vida vegetal son muy difíciles.

Causó mucha alarma que en el playón de ingreso al lago Uru Uru se han acumulado 8460 toneladas de material plástico (botellas descartadas, contenedores, juguetes, bolsas plásticas, neumáticos) presentando una imagen impensable que refleja años de contaminación humana.