El nuevo equipo se llamaría Linzer Sport-Klub y adoptaría los colores blanquinegros que actualmente mantiene.
Tras ganar varios campeonatos amateur en los años 20 y 30 y varios campeonatos de Liga de la Alta Austria, el club se pasa al profesionalismo e intenta lograr categorías superiores, algo que consigue en la temporada 1949-50 cuando debuta en la Primera División austriaca.
El Linzer ASK consiguió en 1965 los títulos de Liga y Copa, consiguiendo un doblete histórico y convirtiéndose en el primer equipo que no era vienés en vencer en la Primera División.
Durante esos años también había sido finalista de Copa y quedó en buenos puestos en Primera.
El equipo debutó en competiciones europeas en la Recopa de 1963-64, cayendo ante el Dinamo Zagreb.