Expandió las fronteras del sultanato a expensas de sus vecinos, particularmente el Emirato mengücek y los ayubíes, y estableció la presencia selyúcida en el mar Mediterráneo con su adquisición del puerto de Kalon Oros, más tarde rebautizado Ala'iyya en su honor.

Pronto fue capturado y encarcelado por su hermano en un castillo del oeste de la península.

A finales del siglo XIII, estos mismos turcomanos establecerían el beylicato de Karamanoğlu.

Al principio Kaikubad había buscado una alianza con su pariente turco Jalal ad-Din Mingburnu contra la amenaza mongola, pero no sólo no la consiguió, sino que Jalal ad-Din le arrebató el importante castillo de Ahlat.

El sultán le derrotó finalmente en la batalla de Yassıçemen (1230), entre Sivas y Erzincan.

Sin un sucesor claro, a la muerte de Kaikubad estalló una guerra civil entre varias facciones, en la que triunfó Kaikosru.