Sin embargo, ese mismo año surgió la idea de un nuevo proyecto futbolístico en San José Pinula, un grupo de empresarios y directivos pinultecos empezaron los movimientos para devolver el fútbol al pueblo josefino, fueron José Luis Del Cid y Nicomedes Ambrocio quienes dieron forma al proyecto.

Concluido este torneo se alcanzaban los objetivos principales, conseguir la permanencia y solventar el déficit financiero.

El campeonato comenzó de manera negativa con una derrota ante Siquinalá por 4-1, en la segunda jornada, los pinultecos lograron vencer 1-0 a Bárcenas, pero luego de esa victoria el equipo tendría un desempeño muy distante al del torneo pasado, se presentaron resultados desfavorables, consiguiendo en las siguientes 8 jornadas un saldo de 5 derrotas, destacando una muy abultada por 7-1 contra Tigres del Jumay, un 1-3 frente a Villa Canales como local y un 4-1 frente a Villa Nueva.

En miras de levantar el nivel del cuadro de Pinula, se formó una nueva junta directiva, y asumió como Presidente el Señor Juan Ispache, quien tendría como misión hacer una temporada exitosa y lograr un papel protagónico.

En la parte complementaria del campeonato levantaron cabeza con su segunda victoria consecutiva, derrotando 1-3 a Guatemala F.C, pero la racha duró poco, pues volverían a perder ante los cremas, pero esta vez por una goleada de 1-6 de local, siendo este su peor resultado del torneo.

Tras la nueva eliminación, tocaba dar vuelta a la página y encarar el final de la temporada en el Apertura 2014, e intentar revertir la seguidilla de torneos intranscendentes, con un plantel sin muchos movimientos y la misma dirección técnica.

La alegría sería efímera, pues en la siguiente jornada cayeron 2-1 ante Capitalinos, después ganaron su segundo juego al derrotar 2-0 a Guatemala FC, y caerían nuevamente contra San Juan Sacatepéquez 4-3.

Nuevamente se efectuaron cambios en la dirección técnica, y se contrató al destacado exfutbolista guatemalteco, Julio Girón, leyenda de los "Rojos" del Municipal y que formó parte del mítico equipo que obtuvo el famoso "Pentacampeonato" para los escarlatas.

Previo a iniciar el Clausura 2016, se dio la sorpresiva salida de Julio Girón de la dirección técnica, y durante ese torneo Juventud Pinulteca sería comandado por Julio "el loco" Leiva, la meta era mantener la regularidad del torneo pasado.

La segunda vuelta del torneo sería igual a la primera, perdiendo nuevamente ante Municipal, Chimaltenango y Amatitlán, también por goleadas.

La nueva temporada estaba próxima, se ratificó la continuidad de Leiva al frente del equipo, y el desempeño debía ser mejor.

El Apertura 2016 arrancó en agosto, con resultado adverso, perdiendo contra Capitalinos 4-0, y en la segunda jornada derrotaron a Sanjuaneros por la mínima.

Tres derrotas ante Capitalinos, Sanjuaneros y Fraijanes mermaron aún más a Juventud Pinulteca, sumando de nuevo sobre la mesa por la desafiliación de Bárcenas, otro empate ante Chimaltenango, una goleada contra San Antonio La Paz, y una igualdad más frente a Municipal recrudecieron el mal momento de los pinultecos, que terminaron sextos en el grupo sin aspiraciones, sumando un torneo intranscendente más al historial.

La temporada siguiente se dieron cambios substanciales en el equipo pinulteco, entre ellos el regreso a la presidencia del club de José Luis Del Cid, tras la solicitud de algunos aficionados, debido a su buena gestión años atrás.

La primera vuelta terminó con 4 ganancias y 3 derrotas, el equipo aún iba tomando forma.

El Apertura 2018 inició mal para los josefinos con un descalabro en casa contra Capitalinos, luego sumarían una unidad frente a Palín.

Sumaron un punto al empatar ante Municipal, y cerrarían la clasificación perdiendo 2-0 ante Juventud Amatitlaneca en el San Miguel.

En las jornadas siguientes consiguieron 3 victorias consecutivas, después sufrirían dos caídas y sacarían un punto frente a los Rojos, se repusieron al cobrar revancha ante Palín ganando 3-0.

La nueva temporada estaba por arrancar, Gustavo Reinoso continuó al mando del equipo, y se hicieron algunas variantes en la plantilla.

En la séptima jornada demostraron su buen nivel, al derrotar al líder del grupo, Tellioz, por 1-0, arrebatándole el invicto al equipo tecnológico, en un encuentro emocionante, en el que el cuadro de Tellioz venía envalentonado, a lo que se sumó que algunos jugadores importantes para Juventud Pinulteca en torneos anteriores habían fichado con los "tecnológicos", entre ellos su capitán Saúl Phillips y Sergio Reinoso.

En ese mismo torneo coincidió con la aparición de la pandemia del Covid-19, por lo que ante la emergencia sanitaria en Guatemala, se tomó la decisión de suspender y posteriormente cancelar el torneo en curso, por lo que Juventud Pinulteca no tuvo más participación en el certamen.

La pandemia afectó al fútbol guatemalteco y el equipo josefino no fue la excepción, se dieron cambios significativos, principalmente en la administración, tras la renuncia de Luis Del Cid como presidente del cuadro pinulteco, y con él su junta directiva, tras varios años al frente de la institución, para atender asuntos personales.

El futuro del equipo era incierto, y debía empezarse una nueva estructuración de cara a lo que vendría.

Los cambios en el equipo fueron profundos, desde la dirigencia, la plantilla y la dirección técnica; a finales de 2020 se realizaron nuevas elecciones para la presidencia del club, en las que resultaría ganador Jorge Camey, exentrenador del equipo de fútbol 7 Astra Pinula.

A esto se sumó el fichaje de algunos jugadores que venían destacando en las categorías de ascenso, entre ellos Carlos Sandoval y Erick Lemus, quienes complementarían la escuadra del "Tanque" Sumich para el campeonato que iniciaría en 2021.

Tras varios meses sin actividad en la Segunda División, y debido a la pandemia de Covid-19 la liga decidió realizar un único torneo en la temporada.

El arranque del Clausura 2021 se postergó varias semanas más debido a la crisis sanitaria, mientras tanto, Juventud Pinulteca seguía alistando detalles y jugando partidos amistosos.

La primera parte del campeonato culminó positivamente para los pinultecos, manteniéndose en los primeros puestos de la tabla con 4 derrotas, 1 empate y 2 derrotas, demostrando un buen juego, con el objetivo de potenciar el desempeño del equipo, para iniciar la segunda vuelta con miras en la clasificación a la liguilla.

El coloso de la colonia Santa Sofía estaba preparado para albergar la final, era la primera vez que un equipo de San José Pinula disputaba el título, y se vivía un buen ambiente, la afición josefina asistió a apoyar a su equipo.

Todo se definió en el último penal que fue ejecutado por el goleador juvenil Erick Lemus, quien anotó al estilo "Panenka" para que Juventud Pinulteca se coronara campeón de la Segunda División por primera vez en su historia, derrotando a Amatitlán 4-3 en los penales.