Sin embargo, Andrés Manuel López Obrador rechazó cualquier tipo de acuerdo por diferencias políticas, marcadas especialmente tras las elecciones en el Estado de México, cuando los candidatos del PRD y Movimiento Ciudadano continuaron con sus campañas rechazando apoyar a la candidata de Morena, como sí lo hizo el Partido del Trabajo.[8] A finales noviembre de 2017, los dirigentes de Morena y del Partido Encuentro Social (PES) anunciaron que estaban en pláticas para formar una posible alianza.[9] En este sentido, Hugo Eric Flores, presidente del PES, afirmó «tenemos dos opciones, ir solos o con Morena».[10] El 13 de diciembre se oficializó la coalición entre Morena, el PT y el PES bajo el nombre «Juntos Haremos Historia»,[11] tras la firma del convenio se designó a Andrés Manuel López Obrador como precandidato de las tres formaciones políticas.[15] Ante esto, la presidenta nacional de Morena Yeidckol Polevnsky mencionó que su partido cree en la inclusión, el trabajo conjunto para «rescatar a México» y que seguirán defendiendo los derechos humanos,[16] por su parte Hugo Eric Flores Cervantes, presidente nacional del Partido Encuentro Social, mencionó que «la única posibilidad de un cambio real en nuestro país es la que esta encabezando Andrés Manuel López Obrador» y que su partido había decidido ponerse «del lado correcto de la historia».