En 2011 se le concedió, junto a Bruce Beutler y Ralph M. Steinman el Premio Nobel de Fisiología o Medicina.

En 1978 Hoffmann sucedió a Joly como profesor de zoología y biología general en Estrasburgo.

En el ser humano hay proteínas similares, denominados receptores de tipo Toll, que juegan un papel importante en la diferenciación del sistema inmune entre propio e impropio y que unen la Endotoxina.

1994 wurde Hoffmann Direktor des Instituts für molekulare und zelluläre Biologie des CNRS, das auf dem Campus der Universität Straßburg gelegen ist.

[5]​ En 2011 recibió, junto a Bruce Beutler y Ralph M. Steinman el Premio Nobel de Fisiología o Medicina, haciendo así honor a los descubrimientos de Hoffmann y Beutler sobre la activación de la inmunidad innata.